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答案已更新，对各大期刊侧重方向做了点评。
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letpub可以查到，但是不一定全面，因为有的期刊属于地球科学综合或者和其他学科有交叉而没被这个网站算在海洋科学类里。
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我在这里说说物理海洋学方向常投的期刊吧
5 X; J, ]$ c3 r) M7 I+ V# P 业内高度认可的专业期刊：Journal of Physical Oceanography
9 l9 ]2 l8 [: n, ^) L+ O; o \ 海洋科学综合：Journal of Geophysical Research：Ocean、Progress in Oceanography（偏综述）、Deep Sea Research、Continental Shelf Research、Ocean Dynamics、Journal of Marine System、Estuaries and Coasts、Estuarine Coastal and Shelf Science、Frontiers in Marine Science、 Journal of Oceanography
3 @; d) Q4 R" o9 P0 f) i （其中JGR-ocean为海洋类最常投的杂志；DSR侧重深海，分I和II，II通常以专刊形式接受指定话题的投稿；CSR不仅侧重陆架，也接收近海河口的文章，另该杂志不收版面费；OD专注物理类文章，适宜投不中JPO、JGR的理论物理文章；EC是河口近海研究的重要期刊；ECSS是近海河口适宜灌水的期刊；JMS上生态类文章质量更高，物理类文章质量较差，适合以生物化学为主题附带物理过程，研究完整但创新性不够jgr的文章；Frontiers是新兴期刊，侧重化学生物，审稿人不够专业；JO为日本人创办，适宜日本附近海域数据和论证不够说服力的文章）
$ w$ F6 i* ?! n9 r 地球科学综合：Geophysical Research Letter
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（GRL文章篇幅较短，创新性强）
6 H; Y1 p, \. U$ L4 d 海气相互作用：Journal of Geophysical Research：Atmosohere、Journal of Climate、Climate Dynamics
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（以上三个杂志均为大气、气候类，JGR-ocean和JPO也接受海气类文章）
8 x6 G# w c3 z3 C! X1 f, P 数据同化和数值模型：Ocean Modeling、Journal of Atmospheric and Oceanic Technology
; L$ O7 B% r, f; `+ T: { 物理-化学-生物相互作用：Limnology and Oceanography、Journal of Geophysical Research：Biogeosciences、Biogeosciences、Science of the Total Environment
9 h' t; x3 S& p5 w0 H1 ]( A （LO是海洋化学生物类的顶级期刊；总环虽然是环境类顶刊，但现在越来越水，审稿周期短且审稿人对海洋方面不够专业，适宜海洋生态类文章灌水）
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NS旗下：Scientific Report、Nature Communication、Nature Geoscience、Nature Climate Change、Science、Nature
( a3 Z* ^3 ^& F2 F7 b （其中Scientific Report是大水刊，其他包括nc都比较难投，相比纯物理海洋，生物化学和海气相互作用更容易投中ns）
% f; L+ y" r6 B% d& J 综述类：Annual Review of Marine Science、Annual Review of Fluid Mechanics、Oceanography
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（以上三杂志均为约稿，不接受自行投稿，适合入门者学习，其中Oceanography侧重描述和科普）
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其他还有一些流体力学类的期刊，比如Journal of Fluid Mechanics 和Environmental Fluid Mechanics，其中jfm作为流体力学顶刊很难投，其他的我不太熟悉就不一一列举了。
( k/ `2 S0 N1 n, u1 p 最常投的就是JGR、JPO和GRL
# s# L5 }8 h' `- Q7 Z7 }1 s 对整个海洋科学类来说最常投的就是JGR
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当然国内研究生毕业最常投的是Acta Oceanologica Sinica 和 Chinese Journal of Oceanology and Limnology，不过这两个杂志都是国内的，不太符合题主的要求，且影响因子过低。就国内硕士研究生毕业来说，如果研究是河口近海陆架区域，国外期刊投ECSS，其他投JMS碰运气。博士生研究生建议专注于投一篇JGR，如需多篇文章毕业，建议用JMS凑数。
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