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) b# k, `, Y9 F6 F 文图/寇琦 李新正 $ X/ m, y S6 |/ U
中国科学院海洋研究所
% Z1 B4 A" i% Q# c9 i2 E8 N 本文节选自《知识就是力量》杂志
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我们知道,绝大多数的生物都是以DNA作为遗传物质的,并且不同种的生物之间,它们所具有的DNA序列也是不一样的。凭借这个特性,生物学家们设想:能不能借助DNA序列来对生物进行鉴定呢? 0 S- I- D. P) Z" R& g
进入21世纪,伴随着DNA测序技术的快速发展、计算机及互联网的普及,这一想法成为了现实。这,就是我们今天要跟小伙伴们介绍的DNA条形码技术。
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1 b% g* X+ | e2 F; F. p 海洋生物DNA条形码技术 Z$ Q) S# d* r4 S2 b
DNA条形码技术与超市利用条形码扫描,区分成千上万种不同的商品十分类似,就是利用一段标准DNA序列作为标记,以实现快速、准确和自动化物种鉴定的技术。 : Y# Q+ v" a6 G& [) m: E0 z' q
海洋生物DNA条形码技术是以各种海洋生物为研究对象,在具体操作过程中,它包括两个方面,一是海洋生物DNA条形码数据库的构建,二是海洋生物DNA条形码数据库的访问和使用,这二者是相互对应、相互促进的。前者是技术的基础,它为使用者们提供了大量数据与资料,作为一个资源整合与共享的平台而存在;后者是对该技术的应用,它在帮助使用者们解决一系列与海洋生物鉴定相关的问题的同时,也促进了建设者们对数据库的不断完善。
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% B( w' |. I4 U; u6 {0 T 海洋浮游生物标本库 f6 h% G9 F: b& v6 p! K! t
科学家如何挑选DNA序列?
$ h% H: A; `0 n# T6 S3 T2 K M. g 适合作为“条形码”的DNA序列,科学家们是如何选中的呢? - d4 S% O+ ^6 H% e* v" Q
通常来说,能做“条形码”的DNA片段,要求长度较短、易于扩增、变异率适度(种间遗传距离明显大于种内遗传距离,以形成相应的条形码间隔)。此外,该目标片段还应当具有足够的数据库信息,以便在获得DNA序列后,得以进行序列比对和人工校正。
( D; Z5 Z# @1 _( R8 H7 b 科学家们通过构建简易的进化树,并计算样本DNA序列的遗传距离,就能判断未知样品与数据库中已知种类的关系了。
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海洋生物DNA条形码技术已经在众多领域崭露头角,我们相信,随着相关技术的不断完善和革新,未来海洋生物DNA条形码技术一定有更加广阔的应用前景。
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