贝类科学家：我不伤害你，只用一点海水就能获得你的DNA（海生张编译） - 海洋生物DNA分析

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非损伤性取样（non-invasive sampling）是指在不捕获、不触及，甚至在未亲眼见到动物的情况下，收集不同形式的样品（毛发、粪便、尿液、鳞片、卵壳等），进而获取样品中的DNA的取样方法。

与传统的致死性取样方法相比，非损伤性取样规避了对实验动物造成的伤害，保障了实验动物福利，在濒危动物资源保护、经济物种全基因选择育种等方面具有重要的研究意义和实用价值。

2019年11月，来自英国南安普敦大学的研究者们在Frontiers in Genetics期刊上发表了一种适用于贝类的非损伤性取样方法——环境DNA（environmental DNA，eDNA）取样法。环境DNA指环境中游离的DNA分子，在自然环境中分布广泛，主要由生物脱落的皮肤、唾液、配子、分泌物等获得。最早是Ficetola G. Francesco等人用于监测淡水中青蛙的分布，现在已应用在生物多样性检测、生物量估算、监测入侵物种和珍稀物种等。

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研究者们以活体欧洲扁牡蛎（Osrea edulis）为研究对象，将其单独放置在不同的海水容器中，72小时后用直径0.45 µm的硝酸纤维素滤膜过滤75毫升上述海水，可获得牡蛎分泌到海水中的eDNA。以此DNA为模板进行PCR扩增，获得了的基因分型准确性达100%。用于实验的牡蛎个体均保持了良好的活性，证明了eDNA的收集可用于准确且非损伤性地对双壳类进行基因分型，也可能适用于更多水生生物，在家系亲子鉴定、优质亲贝筛选、野生资源保护等方面有广阔应用前景。

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将每一只牡蛎放在“单间”暂养72小时

但是这项研究报道的实验方法还有些不足：获得eDNA需要独立的养殖空间、复杂的海水过滤装置和漫长的等待时间（72小时），另外，DNA提取过程有待简化，不太适于对大批量育种亲贝的筛选。

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原文阅读：https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2019.01159/full

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