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浅析sklearn中的数据预处理方法

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+ t, M1 f8 f9 { _$ I

简介

N& A- D) A- J& n

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

& m x% }2 e3 R; c. N

数据集准备

' b9 B# L+ ]5 ^7 E- W

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

' A+ k+ p9 }- z/ ~' O1 N' r6 Y
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集8 U0 \7 ~% T2 w! W5 h import numpy as np # c) W6 M: F! }* R& O' B+ r 1 A+ A c- z' p; j" E Z( V, _# Z iris = load_iris() # 特征矩阵( o' n) _3 {' ?, r8 h2 ?. `, M print(iris.data.shape) # (150, 4)3 }( E! L0 P( } e; s+ n/ b print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]]0 |$ p1 ]* h$ O% ~, m f print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2]; `+ Q8 Q% h: `5 A. `# U: S
' i# m! Y$ b' v0 }! T! p

无量纲化

4 b$ G% ?: Q! g0 ~6 N

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

$ B& H L- [4 M# a; l' o, s

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

! e* U) _" T, q! u, C7 C4 h$ O8 F

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

+ N+ s0 D/ k2 x+ w0 t6 U

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

' D1 R7 h1 d8 L4 N' \3 t" Y% f

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

4 L3 v3 } S% J' }$ E+ W& \4 Z3 {

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

; @, S2 D& @' j

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

. Q. m# J. L* S* \( H

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

% S m8 }$ Q( b" h( Z

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

! l3 a! z6 m* `; y4 B& r

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

W F+ H0 `1 `

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

$ h* K* y1 ^) g4 A, O1 B8 {( _2 ]

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

0 A, B# A+ T N! |6 y6 n3 j" \- o
from sklearn.preprocessing import StandardScaler: D% t; N- ]1 U4 V- I" z; [9 `; N ' y8 o! l$ L$ H& u, ?# q5 U # 标准化,返回值为标准化后的数据 6 G1 h3 Q0 k$ _( C% p/ i" h standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data)+ t2 c4 f) f& @; F: G* Y3 q print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]] " K: q. K! i1 w$ \ Q+ ?& K5 U
8 M) d, f, g$ z" B

归一化-区间缩放法

; B; X, E: K. p

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

6 V5 N Q& }5 e' U0 S

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

. r" d7 A# s9 D' |, F5 Q8 ~5 T9 }

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

$ H6 j) b& T! Z2 l* X

常见用于神经网络。

- p( W& i! I0 d5 j1 c- _

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

" p/ j; B" N# ~( G
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据 1 r, L, `% Q: l( x8 P/ A! X1 _9 Y8 S% Q from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler: Y' ^5 F$ G, \7 s1 G# `* v * c9 ` c& M7 T' B7 |1 } min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data) p% [* Z) p T6 Y& ^ print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]] ! p- r; i& H7 J3 ~: r# h2 Q
2 S: q4 p3 \7 Z q! b& p8 ^/ ]

正则化(Normalization)

, k; b" s& J+ I' K `6 B! Y; j' p

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

4 }9 Z6 y, N7 i0 u% f

常见用于文本分类和聚类。

, N- Y; a: _$ H3 a

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

, t6 C( O, F$ d! e& h# c

LpL_p范数的计算公式如下所示:

& K- X: A; b" S6 J+ n+ z+ m h) u

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

0 t9 W/ E$ K; i+ `

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

) E t a% P2 w/ a6 G, d

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

) v. P& Q: U( |, j

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

8 g$ i" o2 W( _' v6 i h

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

; ^. t1 D5 w1 j) [* e
from sklearn.preprocessing import Normalizer0 ]6 L b- ]% n- Q 3 K7 @7 w2 M8 W8 ?9 q6 j norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data) ! ^2 {0 I) p9 L+ o print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667] ( J1 p+ H, T' y6 Q
1 D4 r# U: ^; u ^2 z

参数说明:

9 l; z- Y+ A. H

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

0 u3 s0 Z3 H( i

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

; h* D. A: u0 C1 a

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

. {( ~" n {" _) c3 D) z

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

$ E0 \! p, K. V+ N/ ~6 u% h

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

; B- y' H$ r! u s, z5 O
from sklearn.preprocessing import Binarizer 6 M+ d3 _; B8 ~, j% L- |9 `+ i$ Z4 |+ {, R; ]1 C1 Z! } # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据 + ^7 F* s( u2 H6 e binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data)7 R2 R! |2 @" B8 h1 z' K. N print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]] / q) v7 c' w0 `0 k2 `
: O/ L% }* T- b+ n/ s5 _ s* D

对定性特征独热编码

3 r* B) Y- U' g( M

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

2 z2 h$ A4 n; C$ G" r$ W' ]

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

& |2 h# \7 {6 s" H$ t! ~4 S* [* d/ F

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

* \; g: d# B) }& |# _) n, A
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据4 {0 M* X9 A. ?; J from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder1 m; S# g" s! Z& ? V9 v7 }2 R import pandas as pd 0 Q( f1 u5 i3 r* E5 e; t: N& z. E2 `# I# q. P" P7 @ H1 Z print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1) ( G+ }0 z+ M' O7 L5 T+ q one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1))$ Q9 z5 U0 p) d print(one_hot.shape) # (150, 3); J) k, Q g/ T; E 8 k7 e ~/ w @* d6 o" _ dummy = pd.get_dummies(iris.target)8 t; \1 l& [) c& t print(dummy.shape) # (150, 3) " p+ \; a# n7 B* A. h3 w" r
- l' F4 Y* A$ q# R; S

缺失特征值补全

! z" }# \" a. z# E4 Y

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

: o# i2 |* F: x5 Q: I0 X3 b0 ~: y

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

- r! _; t; s6 g; Y
from numpy import vstack, array, nan + w( @* n3 E4 b # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据 * w+ U7 I, B3 Z% t) l, M; ^ from sklearn.impute import SimpleImputer# j. G- D# p3 U. }# J& p# J* ~& U 6 x2 x" F, @4 a5 O; y # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN ) b v, R7 M' R # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值)5 U/ o( Q9 D! z% Z2 W, O, y imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean")- e4 ^3 ]- M2 G5 T& D) Q7 o& H 7 r' }* r- k) M+ Z& h4 D data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data)) 0 U9 d, F: C5 y+ `! s print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] $ G$ I! C% H/ Y8 ?9 w4 K result = imputer.fit_transform(data)- H3 {- K/ s1 b print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]] 6 c. o/ z, H7 R
0 ]3 M% J) E4 N0 x& U; i; q" e& J* r

数据变换

8 V: }% z t" t; w

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

8 b$ X4 m2 ]* Y7 |( u4 `0 J

基于多项式的数据变换

- @2 T* F( a# o0 m& t2 T

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

6 b0 ^9 U) F; j* a

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

% u) f8 d. T2 [2 A3 ~4 ~

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

: m1 S0 S' I; I y0 `- x* E' a

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

( O2 N( ^7 { m7 J; V1 J
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换# E0 M$ l" H/ M7 D. p ]: w # 参数degree,默认值为2 ; V+ N- R8 H% x% ^. M6 P6 l ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data); r s4 L. x: c- [- U) _ print(ploy.shape) # (150, 15)$ f ~7 y' y4 A! A print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]]' z3 g4 K& |% l: s7 C. p
6 @+ G0 V2 R9 {6 B2 f1 [9 a

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

) O) Y" k6 d& h( y

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

+ ]/ l4 k% c7 f# o8 Z8 s# y

基于对数函数的数据变换

2 C; Y. Q o" Z' t- Z, p* ^. t

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

/ d& i! D% V) \, \( Z. o1 }

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

0 a5 [+ k: D& O3 F# g8 S
from numpy import log1p: q* w# i5 u' f& v from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer: e# X* g z T. m # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射8 e. C9 A, b; B4 Z9 G5 t$ V # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换 ! P4 W1 r' y- B; O/ T& F # 第一个参数是单变元函数 8 I- {3 I. \3 R log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data) 2 @% d& m- B( I8 e print(log_one.shape) # (150, 4)) H) L6 K( L; y2 }7 e$ d1 ]6 J9 |+ @ print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]]$ A/ S6 n& l! [/ d- M% x1 j
# }+ I+ Z8 x4 w3 Q, Z

总结

/ s( @7 P7 B$ ~6 s0 A1 K) z# g

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

7 m7 j- ?6 B, C3 G
8 P( b6 E# Q9 {2 C# X( p& z

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化 9 ^- S- d: ^: W" Y6 q 9 j0 {. l/ Q S! [# M! h5 [( {2 J, A- V8 Y3 O, U ; e+ _5 W. A9 p, {0 E 2 C y' k: e0 j+ g. |! I) x
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