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浅析sklearn中的数据预处理方法

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2 ?% L. z J ~

简介

, l3 u0 l2 ?# k) X5 L

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

& n! I. P- `; Z# U, F7 j

数据集准备

6 `" K/ Y$ P: p* n- h6 V; P; Y* x

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

, _+ N; u# {. J4 S1 P! k* r
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集 5 o' V0 p6 q3 V2 L import numpy as np ' B& X% d4 ]0 f9 Z. y! a; o9 U/ [8 q! C- H' N K iris = load_iris() # 特征矩阵+ z( i) e, |$ Y- Q8 [ print(iris.data.shape) # (150, 4)- m7 G$ ?( i3 `1 L2 a# c print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]] 0 Q* p5 p6 {; n! y U4 m& g0 R- [ print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2] % a. s+ M/ ?, b: l$ u. X! I: n! C
; d( h, o- Y" z# c9 \" X$ d

无量纲化

* \- D6 U0 d( Z

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

9 G" s* I: O/ \" H& @: c

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

. W. m( z. I" U( l1 a

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

\( {6 F8 B5 W( s) s

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

+ u+ {0 h, K0 |! f; Q: G

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

" D, Y' P# B% G0 x' m

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

9 N+ t9 V" k% X1 a8 y( n& r

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

, n: F1 }+ r! p# [

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

H5 e3 { }6 e

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

4 J2 k) ?& s4 R' x& U

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

' c5 v4 A W2 _3 b. n; U

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

d- v! [( c# v4 [

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

9 N$ T2 ?# l* ~: f- u+ J* h7 F
from sklearn.preprocessing import StandardScaler 3 |! U: \6 B3 I$ u' ~) b+ |+ p" j( ^4 F, o8 Y # 标准化,返回值为标准化后的数据 ; d& w6 ?9 ?: o e5 i0 ? standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data)0 g, t$ N c- r# M print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]]5 E& g" b5 w5 W$ y% w/ L+ G
* D3 A' M% o1 N+ G" p @/ T: M% y, u

归一化-区间缩放法

5 E6 F( i$ ]+ k) w

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

" l4 Q0 m: V5 j! R. O. D

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

) g5 }; [$ s' ~: `/ J4 |: L

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

5 Z, H& }4 ?5 V5 \6 q

常见用于神经网络。

. A; n! {: M# ^/ t# }" a

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

- L! n, h5 D. u3 g1 ?0 S: F! \+ P; B3 n
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据2 s& q- P4 I0 B0 Q* a% N+ h from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler( ^/ G3 a i7 |4 b ) }# ]' I* A( d0 Q+ ? min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data)5 v- O- M( \/ d# E, d print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]] . G% D* |; ]" T2 n A
" n3 W) N3 ]: r6 K2 F

正则化(Normalization)

( D% R. z+ |" v

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

0 }1 R+ E4 r; l+ p/ P

常见用于文本分类和聚类。

. ~/ p3 B+ e- \5 P" A( [

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

9 n9 @2 ~& z$ c+ K' `/ q' Y# }

LpL_p范数的计算公式如下所示:

3 F9 W& H" Q5 o' J- j. k

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

: u& r" N! I& A5 ?- R, F5 d! R

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

5 f% D3 s/ Z; \" x1 q0 Y

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

9 ]0 Q" W0 F6 n7 x

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

4 v$ [! R; J) O3 E+ H

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

3 {3 Q! i5 t9 R) s# ^$ P6 O
from sklearn.preprocessing import Normalizer; k2 A+ Q( d0 e& n1 X+ G- ` , N8 q$ a: m- }7 I* O; ]! n norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data) 4 ~0 o, H7 [: }7 x+ C+ D$ u' } print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]$ O* m* o3 h8 N2 Y% j
) a! c' p% n1 L* L: [

参数说明:

- Y8 n* J" {$ i' x

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

' U- ^+ Q. P/ g) }6 {0 j, {

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

1 R3 T) q3 }' z. H# c

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

- A, ~7 l7 d" }% |6 ~- S

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

: J- d O, R# ~/ i1 ^# G

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

% w2 J' h- `. j8 h( x! y: P% R) L
from sklearn.preprocessing import Binarizer) v2 ~, z5 D: C1 y) U 4 S4 e5 r% |* p+ b8 e# p # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据 $ ^6 E) U# N* N& y9 m. ^8 I8 ^ binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data)- ~/ v- {% L4 [3 [1 i V print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]] - A, t8 d) Q# w5 n; b' t6 G
! Y! @1 e( l* q. O" I& Q* i

对定性特征独热编码

$ v& u- d/ F& w7 ]( p

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

0 `% ] x! j6 i* n& ?; {5 G- A

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

" r% `3 e) a9 p/ I# E7 N% e/ N

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

# F( B! x; c V0 t4 d1 T
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据 j0 d% |+ ?& C i) y7 o' M7 B from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder6 Y# X. o; W: F k# U import pandas as pd: q$ z6 P: x2 ^1 [: w# M ; Z# G: A1 _" ` print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1)* ? R/ ~/ v( Q h+ k one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1))3 f% [7 v5 z+ P) H% M& Z% m print(one_hot.shape) # (150, 3) 1 a" v0 x, c/ c) p6 p' H! R1 n . i) w0 m9 \! ^ @ dummy = pd.get_dummies(iris.target) , j# u+ ]: T% a% S) M' ~3 m print(dummy.shape) # (150, 3)7 z9 x( T: {0 k2 v. L2 l t
1 E0 D# D& h8 E( |7 h

缺失特征值补全

. l) ]. \( Z, R" p; s' w% g

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

0 A7 I/ ?* c6 m! R

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

$ P) Q9 U% @" ]8 [" g7 Y
from numpy import vstack, array, nan 8 w ^ f& s( L: U- {4 ^ # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据! r! i# |( U5 g from sklearn.impute import SimpleImputer3 T O+ \$ J) P6 N! @ 2 |$ c9 E9 V. U3 ]7 M9 h$ k # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN 4 N6 r* R$ b" G. d # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值) % s% I2 _/ O/ o2 ^ imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean")' \/ {7 K$ F/ B) |6 f & g8 Z7 [# A! A! n' b: f+ w: q5 M data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data))2 p* ~; G6 q1 `% ^8 }" R5 f print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] / s- E. ?; r, B1 ` result = imputer.fit_transform(data)6 }; [# {2 U3 N( i& p: d( | print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]] % J u( Y! t+ N- W. r
" ]$ a/ B2 L9 q% x2 l6 N

数据变换

3 {+ y# i% r, M+ L) W) \9 r. \* [# t

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

9 m+ L3 I, t' ^- e5 f! A- n0 B

基于多项式的数据变换

1 x5 _+ c8 w# j0 i$ A. K6 G

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

. A( _: q3 Y' H- B8 R

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

, [ G0 a6 e) O

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

8 J: c% d2 X+ F

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

: P: c: F( U9 [. |
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换1 U! i: M" k$ C' x' q9 T # 参数degree,默认值为2! i D7 k$ A1 {4 V ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data): |4 [3 `* E# I print(ploy.shape) # (150, 15) 0 i: K6 N \, p" { print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]] & `- y8 f* i! c9 S0 v
7 Z! X9 E; _3 v+ W# [, Y, @" h& G

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

" g5 B) R6 a! ]

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

/ ]) b! P2 D0 n: I1 U) i' i7 l

基于对数函数的数据变换

% u. [) O% Y, @/ U; j4 q

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

0 P1 {( f% }* W9 U6 P& S* {+ p

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

- \8 n S2 K* M* A8 L6 h8 x
from numpy import log1p3 O/ e6 H+ b8 {5 m# J+ o from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer / i/ o- H9 Y5 M2 }: H3 n- ?/ T( d # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射 5 F& n7 T' _( V( q p. I( B8 f # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换 7 V2 c" A5 t0 }' f1 Y" V # 第一个参数是单变元函数9 X" J- J4 Y/ d8 T7 a5 i' \ log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data); t+ A+ a( } i& \) r- T print(log_one.shape) # (150, 4) # p2 I0 S" l, h ]0 `( N) P print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]]4 w, M( J0 X3 v
3 y- w2 F: r0 Q- S9 c! r1 @

总结

3 X7 M3 F7 b/ B8 h5 G

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

5 G) j ]3 \1 g
8 I3 R) f, q, d

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化% e% i% X o. L* Y9 ] * e0 k# \ R7 H6 _6 ^! l* u8 b ! Y2 m& S3 I# @# ]! q! b: E - Q: \: ? c6 \2 Y' @( r+ w- S0 I6 K- x- A C
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