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浅析sklearn中的数据预处理方法

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: Z1 ?+ s6 C: G4 }

简介

( z" T! [, l4 w/ c9 v

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

. _* q; D7 J2 U

数据集准备

! y8 M+ Y( ~, z* H4 A. t" r

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

+ B8 ~( P3 A) c% ?9 z( I
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集 7 F" R4 ?; k* S7 P$ b" K2 B# p import numpy as np/ n" b& r9 b# I2 r U# T9 A: D - E9 y+ m: m- t c iris = load_iris() # 特征矩阵 3 U+ Z* D2 V6 c! A+ |: q) H; z print(iris.data.shape) # (150, 4) ' ?5 k- q/ U% y( ~- G$ M; l) Q; _ print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]]8 V$ |" l6 D# u, ?( a7 v1 m$ W print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2] 1 M. `) |8 }- Q, V% Q
1 e5 N; g; ^$ D

无量纲化

6 a0 O# v/ U' D1 e) a- |8 i7 [

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

1 v& A/ ~( g( u* p! g

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

* w' J$ ~9 ^" ]7 A* f+ M/ Y

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

, e5 z! L6 Z8 ^* P

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

2 o$ E3 v; b% r+ c3 D- T2 Q8 _

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

/ Z1 d5 S8 h7 Y" q$ q& l( Z/ `

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

" K4 t1 P; ?# L8 _$ E/ x( e

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

7 O S# [& t7 [; X) @1 @

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

1 J6 e( F4 ?8 D: x

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

8 r7 Z3 y6 m& a+ H0 s& ?' K

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

3 H9 m" Y% n+ n

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

+ J5 X6 R& s' K" p$ p

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

* v, Y; O8 `4 f0 j2 O/ l
from sklearn.preprocessing import StandardScaler( x: S. P. C* C' Q3 D$ q5 L 0 M& p% A, _ l# F$ M # 标准化,返回值为标准化后的数据 " @, R1 _# [ S standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data) / F- V' d1 v7 J+ r8 Y( N% m print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]] 6 z. A K& Q! K/ M! Z: a) j& E
" }( B1 `, c( |. w, U/ x) f

归一化-区间缩放法

- H* @( ~1 N2 h, D

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

" B. z4 T# T4 Z6 `% @+ E

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

* ?* L3 ?4 J0 ?' k) h

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

! u. l A" D. n) R4 k* t

常见用于神经网络。

4 V2 v" G2 T3 h+ O

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

4 H1 k- b5 O9 }7 B5 }2 @# I' x2 @
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据 ) ~' x( B6 f8 L4 N! c8 F from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler D/ X# p: r2 s. j* F0 L* E ! ~- r% j$ N% q5 s+ F7 w min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data)4 o2 ]. J. v$ a! ]- A5 n print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]]" }- k n- `0 \) u. j
3 N" z4 O" c9 w; N0 O

正则化(Normalization)

6 e" e! M X+ r2 J

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

0 F' |3 R8 L3 z' C, s, O

常见用于文本分类和聚类。

# [9 H3 X0 j: O8 J

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

/ }' y9 K: T# l3 @" {8 _" G3 R

LpL_p范数的计算公式如下所示:

* K8 c i0 c5 F: {

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

1 d4 `* @) k2 a7 X

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

6 |, a, h& [ j: {1 z

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

" _4 o* F6 k* }. }9 z; q5 z

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

, F: q4 ]9 ^ t; n/ @: \3 G

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

. o6 @3 {3 _ ~
from sklearn.preprocessing import Normalizer 3 {6 Z. n" [! P+ V2 |% U6 e: Q: C4 }# R( D. n# `( c |9 K norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data)" E- _8 ~' w/ T F9 u+ n |; T- ] print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]& o, B$ o" g1 L3 R9 \: w: h
9 h( i, g1 O; J+ r: A! k* `: v2 V

参数说明:

0 V1 U- u2 D$ N5 z! ^

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

1 ~& a0 X: r5 }8 U% O

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

" Z1 D1 w4 G8 @3 v% q

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

$ ^% }! R/ h; s# f7 d; ~6 W

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

# N5 b, p! V, ^% M- `; ^

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

% L2 h" o, g5 r
from sklearn.preprocessing import Binarizer$ A e# G7 h8 I$ y6 Y' `% N 2 M3 E _$ p& j; j% Y # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据! F6 l% ]5 [/ n! h4 v binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data) ; z) A2 X; W( W: |, |; C print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]] & T" o3 V) m) k. C, t
$ p; u, N- z- H8 P0 {* X6 k

对定性特征独热编码

4 B* a5 G' X5 v/ S e( f

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

0 F% M8 W2 H2 ]

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

# k& y% I; h6 }, U$ u- j- D

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

. ]3 h+ e0 N" q4 t
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据& b, S$ V+ b& w9 K! s from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder+ l, Q1 i" n+ r8 Y import pandas as pd ' U u0 q7 {; e 8 m, Y) X5 Y* m& O/ ~1 h( T! | V7 P print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1) 0 x% b) x) J( z; v one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1))7 z# Z6 n+ a8 d# r print(one_hot.shape) # (150, 3) : q5 {- @- C, X3 o- Y' u$ Y8 H9 C. i; t7 B3 F, f! @+ O dummy = pd.get_dummies(iris.target)3 z: \% [) [/ r I print(dummy.shape) # (150, 3)6 D1 q: z( ^! \) ?0 ]
2 b& |: R$ h" A5 s

缺失特征值补全

# ^& b' C( N+ i8 a, K

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

+ s7 ?7 ] w1 B0 S5 ~, o

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

4 O# l9 M) T* G! I0 Q) ?( I) g+ j
from numpy import vstack, array, nan $ d! [2 F. F6 d # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据 + U" q/ M7 I0 S9 j9 M5 Q from sklearn.impute import SimpleImputer 0 g2 P3 q% V2 Q* p6 U" w( d$ u+ j% f1 V1 O6 z4 S( m* l # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN 5 [! a8 w/ [! \7 L # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值) ! r# r; a# f/ e* \ imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean")* \* r8 y9 F. o1 w( D' U* I: ?/ L# K . y7 K8 i$ C: E data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data))* F. N, D8 z" D print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] & h2 d8 k/ J" i. B( ^7 H1 ] result = imputer.fit_transform(data) 5 n/ @' A0 o/ u: f2 c" u print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]]3 Y7 ?) _' t; X9 t5 V$ A: |; _# {
) S6 N9 B; ] j! i1 _' B

数据变换

) @4 u2 H+ n. \/ l

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

7 X o" b8 j3 `( F3 y$ U' m

基于多项式的数据变换

. m6 X8 p& K' n5 v( n* u

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

* `: R" P" L& c& `8 |. \$ M& I5 \8 M

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

+ J' U3 ~& Y/ p6 F$ u

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

3 p, B& K2 w. v8 o# Q5 S

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

% u+ W* D$ l) B! S. r1 T- I Y
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换 0 Z9 }5 T& x3 N # 参数degree,默认值为21 e5 f- h; E+ }6 A) \8 _8 k+ Y ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data) 9 k2 k* R7 Y& F8 p3 v print(ploy.shape) # (150, 15) 1 q3 n6 ~6 z& k) z! Q- p print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]] 5 w# z+ T; c9 y% b$ K
, z! D" I u+ {" U3 p H; v

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

9 Q% s3 P' C y: {

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

$ b( a! q" |2 ?4 r9 P @4 T' Y; V

基于对数函数的数据变换

7 Q X! V5 P1 I3 u

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

# N Q! v1 I! O- u- v7 C

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

3 S4 B# E' ]9 X$ v% L: C/ E# s! _
from numpy import log1p( ]* C$ x# L5 t3 {6 U from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer + k5 r! I2 ]2 R& ? # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射 0 ], S/ w5 {+ v1 }: W) c L # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换5 E, E" l; N" Y; b* p" o% x$ G- u # 第一个参数是单变元函数% e0 }4 w8 u5 u( m3 r8 _ log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data)+ `/ O- Q1 ]; p/ y1 x% x8 y print(log_one.shape) # (150, 4) K0 a' a# x0 _+ }% ?) B( O) B print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]]6 n& P0 Q5 o; }: \/ `* q# ^
$ F9 m3 z+ l2 B

总结

+ b. \8 D2 w6 f3 l3 b2 M

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

/ y0 z) P9 K$ O$ _
4 y9 C# @- w& S$ G- l

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化/ W& ~* d$ B: T9 V: Y6 v, H c4 d - r" a( b8 _4 M. o + E9 f, [- S3 \) S+ u. o) _ ! K! _& n$ q0 w8 l. Z- M& c" g: y0 [% X3 e( d
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