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浅析sklearn中的数据预处理方法

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& D9 u8 J) p2 i

简介

; J8 _9 ]7 B) @, {/ C1 T

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

+ h* `$ D' K7 k' G

数据集准备

3 R: B( f, y! A f0 @$ @

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

. u# y W8 Z g8 D1 K/ n5 b
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集 # x; u$ p' w* _! Q import numpy as np6 }, P5 \ N- X0 J 3 ]& L1 }. a+ F( @ R iris = load_iris() # 特征矩阵 ) p+ g6 \: y. o) m print(iris.data.shape) # (150, 4) ' w& v! i; q" W( Y( n1 a print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]]# `8 e4 \$ `* Y) b* F print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2]. g+ [3 J6 P5 T- Y# s
+ E# n4 D. G, P1 [( h

无量纲化

+ ~5 e& p3 c" l, _$ A* L) ^$ H

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

( V! Y+ u* G# d, S; c

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

; W# Z3 ~7 }! P/ h. W

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

" w' {9 ~7 }( I) T2 l

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

7 ^3 ~- r+ q7 U: l7 M! u

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

; w6 ]# t: I% U% f2 n* \8 U2 Y

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

8 G3 n) C# t/ }) S: ^' | H

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

) w9 z- Z6 i7 v

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

9 G: E1 @. S4 G" W/ I4 T- K0 n

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

' h4 Q& c) P$ Y, b- U# c1 y

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

# @; ?) g$ B7 k. T$ U9 W# h

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

+ ?: O, l9 t8 L( @

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

1 }% E$ F. Q" y: A+ Q* S
from sklearn.preprocessing import StandardScaler- ~% E0 T: R% X* @& @8 `6 ?4 y! V( o! \ * r% B7 b4 z: K6 y2 G7 N& [ # 标准化,返回值为标准化后的数据 8 S6 W' t9 F' N1 i* z+ \1 s5 \ standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data); t" D/ d9 j# Y# m0 l; V8 x print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]] & Y- b6 ]+ [, ^
- X; [: i% f6 u; f

归一化-区间缩放法

, m; t4 L) M+ r! G5 _$ D9 o; D

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

) a3 E' p) |6 t

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

. z* b/ p( Y4 I- S5 L" w- \7 F

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

+ ^0 K+ q) O& S) n8 E; Y2 f, n

常见用于神经网络。

7 a2 x& M8 `2 \

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

9 @; S8 S; J) k2 x
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据 * O9 H- _/ t. ?% \. `9 c: a from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler J6 [/ A9 |9 ]/ G, J0 _& F / o; K7 o2 D6 P- `- }7 E min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data)# `4 c- ]2 b4 l" K8 y print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]] : U5 [ u9 C Z& O8 v' S
1 J: U# X7 W; P6 }8 P! N1 B9 }

正则化(Normalization)

\ _& U! O2 x/ C @4 y% R, ^- }' q

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

4 p* ]" Y6 |% c$ K

常见用于文本分类和聚类。

* i4 m+ D& [; v% V. |+ t

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

9 W) g' d8 K+ ^2 v

LpL_p范数的计算公式如下所示:

' ~" }3 X$ _( D; V

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

7 v9 A. G- H4 G5 @

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

/ M0 J& C7 z; \0 u

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

; s* Y7 Q7 I: l% v8 v) X) }, s. v

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

( T: ~1 p+ W/ ~

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

3 \. g! B a f+ Z* j7 ^) U3 y
from sklearn.preprocessing import Normalizer$ p' |* y5 n- | 2 \$ L# |2 I( s1 j& F$ Q. \3 R4 @; }: i norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data)$ B2 y9 q. J0 x* k# [7 ]. U9 V print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667] / E3 A! G4 u( [' B8 B9 U
- h/ _! }, e6 O7 H& v

参数说明:

6 O1 q3 ^( p( K9 p$ R

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

8 e4 P+ B8 p' }) z

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

7 Y1 `. a0 p, r

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

6 d! n% h2 _6 [$ b4 E \

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

! K; k3 i2 `, e0 N: s8 J" y

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

7 s+ t5 z% E* c
from sklearn.preprocessing import Binarizer , {4 h, \, _3 u0 O ! z3 z8 d! K/ t% ? # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据4 W, J/ }; H) p) B, u% S0 W binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data) ) K* \! `7 p: X1 H' G2 C! ~) M print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]] 7 f, h9 t0 N) T: E6 |* y
, Z; z7 D V+ C; f

对定性特征独热编码

6 V9 D% N. j! J# L# d5 ]7 v

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

% }- q& `4 V `( p4 L! A

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

D( {+ q5 L+ |

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

7 l0 a% o) T0 }" g% V, r( l& C
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据 ' _7 Z% s1 I' G. X+ X from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder 3 G) h/ P4 K1 J' k s- D- G import pandas as pd! o, C' i6 T0 {7 Z/ p, P 0 o8 W7 ^/ `5 U4 G5 F print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1) 9 h7 R) L, S! [& Q: o one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1))2 ~( H8 o8 H0 Z% X print(one_hot.shape) # (150, 3) # W9 T( q9 c$ H1 ]9 o$ u6 ^$ \/ C, g2 i. b5 ~; C- C' ^ dummy = pd.get_dummies(iris.target)2 ?* E" E$ s0 _ print(dummy.shape) # (150, 3)1 t- V" t% e0 |, _( n Q
& p8 ` R% i! e

缺失特征值补全

- |3 @. G) J" H0 I4 s$ J1 ^

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

$ C k; D- v* L1 T+ \

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

- U% s8 r: \1 w
from numpy import vstack, array, nan ) w; p" |7 j4 ]6 t9 e0 ^" P& Y # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据 " A5 S0 j( `/ `+ |. j2 C4 e from sklearn.impute import SimpleImputer 9 f; [* L. ?: W2 t& a$ o 6 N S, H5 q/ M: O # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN 1 I# a% D* g* b* p9 ^ # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值) . ]3 B/ D e/ L imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean")9 C! K l/ r/ z9 j 2 e. R! N2 [, }$ _. W4 R; N data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data)) ; j$ [( k, J/ Q- G2 z5 B+ Q: T print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] : X: ^0 Y4 _5 x( I4 C result = imputer.fit_transform(data)* z& e- V' l" p print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]]0 C: j' B0 Q2 k! }! R! C
6 w% x2 {6 |1 Y& S- m% a

数据变换

2 q. n' A- w) H

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

5 O, ~; c k9 w4 M% J6 j" P

基于多项式的数据变换

, q3 _4 f8 @& u$ j5 D0 o$ R

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

* D3 u4 n' A* \: ^

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

/ |* V+ {$ \- j( O+ v% ]: }% s

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

4 l: W9 x; c0 R/ [3 z ~7 C$ I

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

( B: ~. U. j! ?
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换 , n# U3 x' ~2 ^ # 参数degree,默认值为2 1 \4 O- {2 l' Z1 \3 Y% X ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data)% d, m" m' t _; i print(ploy.shape) # (150, 15). D$ ]% I- m6 ^* w D print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]]! P2 ~6 F$ C3 [ b. N$ C* ~2 l
: v; X. e Y; K) c

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

$ R: I7 l" Q; ?

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

9 H& a2 `( g5 ], A9 z- u/ U; n- x

基于对数函数的数据变换

" T! q# m( ]- X) z' X. Q

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

9 z* J2 b, O! L/ y9 g. n; Q' X

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

% V9 S% C' ?) E6 y& X) U- C5 J
from numpy import log1p 2 |% l' j% M/ Q% K- C from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer % G0 u; B- B( C1 L; ~ # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射 . \$ [6 v1 W p# ~ W+ t # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换 3 e9 f# U1 i3 G) w7 x # 第一个参数是单变元函数0 O" D8 ]8 q- i0 G9 X+ u log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data): B. L% k3 H2 `6 D5 e! Y- K! X1 { print(log_one.shape) # (150, 4)% D- ?, W7 A& x; e print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]] ! V; h3 C; u3 g
4 N: h" E2 R7 k# t5 x0 l+ R( Z/ V

总结

. x' s& M; [, R

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

1 c7 E8 P; \1 M4 v
F6 f: G. k6 A8 \* ~, M4 h

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化 / e& A" _+ I0 e: e& H/ v 0 Q2 I: ^5 ^7 x0 n+ i 4 t: `" |% E- @# ^6 T9 ^ O , O0 r' K7 `" H# M5 v0 m" u: y' f0 C7 o4 D. g9 y1 G7 D0 @& L
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